Autoconf fix: wrong variables used for ICC/ICPC.

Merge branch 'master' of git.dyninst.org:/pub/dyninst

bug 1030:  check for and attempt to fix issues with alignment related fields in
the elf header structs.  Left things noisy for the moment so others may look over the
fixes easier.

Fix for bug 1035: fxsave incorrectly emitted when we don't need it.  FPU register liveness, due to the register stack nature, is overapproximated via "does this function contain a write to the FP stack".  This requires that we initially treat the FP stack as dead, and set it to live if we find that it's written to.

Note that while the MM0-MM7 registers overlap with the FPU registers, we check them for liveness using the ordinary algorithm, and so they are initialized to "live".  If any of them, or the virtual FP stack register, is live, we'll emit a fxsave/fxrestore pair.

Added heuristic to look for the movslq sign-extending move that signifies that an AMD64 jump table likely has 32-bit entries

AIX build fix (pdvector vs. std::vector)

More dead code removal (BPatch_dependenceGraph node and edge classes).

Disabled test_instruction_profile (looks for libc) and test3_5 (crashes mutatee deliberately) on Windows.

Test_instruction_profile doesn't *test* much, it's just a profiling harness, and test3_5's mutatee crash causes more problems (Windows nightlies failing to report) than it detects.

Added sanity checks to InstructionDecoder for immediate decoding.  Correctly re-examined the presence of an operand size prefix when doing operand decoding; this ensures that decoding immediates will not access uninitialized memory.

Windows fixes: there are 4 more calls on Windows than Unix in test6LS.  These write memory now.

IAT lookups converted to InstructionAPI for windows/x86.

Optimizations: remove vector that's no longer useful, don't duplicate isCode/isData calls unnecessarily (avoiding log N lookups in Symtab regions)

Removed dead slicing code.

Optimized register ID ordering for faster category detection.

Optimized register promotion, removed dead code

Bug fix: rebinding a binary function's arguments should clear its cached result.

Jump table parsing fix (O|SS et al); register promotion optimization

Bug fixes

Autoconf fixes: ia64 platform typo, export more standard directories; configure rebuilt as a result.

Cross-platform fixes for parsing migration to IAPI; includes experimental Windows call target checking, IAPI version.
Verified on AIX/power, Sparc/Solaris, IA64/Linux, AMD64/Linux so far.

Bug fix: force 32-bit mode for decoding a 32-bit libc

GetInstLevel abstracted to InstructionAdapter base

Cleanup:

* Separate IAPI and InstrucIter adapters into separate files.
* Promote common methods, provide useful IA data members for internals

Everything but NOP detection and instruction copying to instpoints in buildCFG using IAPI rather than InstrucIter.
Still somewhat slow, and needs code cleanup desperately.

Added extra debug logging to loop test (1-37).

Parsing rewrite 1.0: adapter for IAPI/InstrucIter conversion.

Merge branch 'master' of legendre@git.dyninst.org:/pub/dyninst

Fix for segfault when sorting exception block objects

Merge branch 'master' of legendre@git.dyninst.org:/pub/dyninst

Fixes, mostly building, for Fedora Core 11

Fixes for bug 1028:Single snippet removal at multi-inst point

In this fix, we regenerate multitramp when its basetramp is changed.
A new function called updateCode is added to multiTramp class. This function
regenerates new code for the multiTramp when a miniTrampInstance is
removed.
I also fixed a bug in multiTramp.C - removeCode function - condition to
check if a particular multiTramp is the current version mapped in the process
table.

Fixes for instrumenting shared library:
* Fixed condition for checking if a binary is static or not
- We determine if a binary is static by the absence of INTERP
          section. Shared libraries may not have INTERP section but
          are still dynamic. In this fix, we check for the presence of
          INTERP section or the elf type being ELF_DYN
          (dynamic shared library) to mark both dynamic executable
  and shared library as non-static.
* Added place holder for saving referring symbol when creating
  a new symbol from undefined symbol. This is needed for checking if
  a variable comes an executable or shared library to add a dependency in
  DT_NEEDED entries. If the variable comes from an executable, we should not
  add to DT_NEEDED entry.
* Set RT path for dynamically loaded library

Autoconf fixes:

* Pick up binary/include/library destinations from PREFIX.
* Add disable-testsuite option (so that make install will work, e.g. for packagers)

Test build fixes: Instruction to Instruction::Ptr conversion for AMD64, killed dead code.

Several small fixes, including the following:

 - Recursive function parsing eliminates a previously held invariant
   on the order of functions in a block's funcs_ vector. Relying on
   this (nonexistent) ordering coudl cause us to miss copying some
   instPoints in shared code.

 - Kevin discovered an extremely common non-returning function on
   Windows platforms; this is now on the special-case list.

 - Calling the STL set::size() method is slow. Fixed.

Add boost pool headers to external; update IAPI make.module.tmpl so it no longer tries to copy a nonexistent header.

InstructionAPI optimization pass 1:

* Delayed decoding of operands
* Use of fixed-size allocation pools for IAPI objects
* Placement new for frequently reconstructed objects
* Lighter-weight low-level decoding
* Optimized storage of raw instruction bytes
* Eliminated redundant encoding of operand read/write info
* Eliminated many unnecessary copy operations
  - Parameter passing by cref preferred to passing by value
  - Eliminate copy-on-return via shared pointer in public interface, since we can't rely on RVO
* Avoid dynamic casts where possible
* Delay construction of flag objects as long as possible

Update DepGraphAPI to use new StackAnalysis interface

Update StackAnalysis to return shared pointers instead of raw pointers.

Initial commit of new region-based stack depth analysis.

TODO:
  1) Shared-pointer Region tracking so that users can discard a stack analysis object without losing all its memory.
  2) Fill in stack affecting instructions.

Reduce InstructionAPI copy overhead by making fewer copies.

Fix Stackwalker custom ProcessState, Fix Symtab address size

temporarily disable test_symtab_ser_funcs for the release

Use the right path for external/boost in building the test suite.

Add StackwalkerAPI to top level build target

Update Dyninst version numbers from 5.2 to 6.0

Make test_type_info compatible with Windows

Fix bad defines in include file

Fix race condition that showed up in a fork test

Fix for mismatch between C and C++ memory allocation: new/free changed to new/delete

InstructionAPI docs versioned to 1.0.

Merge branch 'master' of git.dyninst.org:/pub/dyninst

Remove DEBUG_FLAG from Makefiles.

Windows build fix

More changes to Makefile.in to set libelf and libdwarf

More parseThat build issues

Changes to build parseThat when LD_LIBRARY_PATH is not set.
We pass dwarf and elf library path to configure.

Merge branch 'master' of legendre@git.dyninst.org:/pub/dyninst

Fix issue where test_driver could infinite spin if a group setup crashed

We weren't setting location structure for a couple types of instructions.

Fix issue where we failed to throw away a junk link map entry

Make strings of nop break basic blocks

Rewriting libc

We were dropping relocation entries if they have index STN_UNDEF and
no name. This was causing failures while rewriting libc.
This commit fixes this. We replicate original relocation entries
even if they have no name preserving its undefined index status.

Fix for parseThat build failures

parseThat build involves executing parseThat/Makefile and
parseThat/$PLATFORM/Makefile. We were setting
TO_CORE (path to dyninst directory) as "../.." which is correct
if we are in parseThat/$PLATFORM/Makefile but
wrong if we are in parseThat/Makefile.

The only reason to use TO_CORE in parseThat/Makefile is to set the
platform if not set, using scripts/sysname. This commit fixes this
problem by setting the path to scripts correctly, without using TO_CORE.

* Correctly open the first dependency that matches the ABI of its parent.
* Only do a full dependency check if we're opening them
* Scan for a thread library separately from opening dependent libs
* Maintain proper recursion for opening dependent libraries & adding new ones

Fix issues with instrumenting overlapping instructions

Merge branch 'master' of legendre@git.dyninst.org:/pub/dyninst

Fix testsuite attach race condition

More windows build fixes

Rewriting static binary

This commit handles rewriting static binaries. We determine if
a binary is static in ObjectElf using PT_INTERP. We use this
condition to selectively not execute code related to dynamic linking
and relocation in ObjectElf and emitElf.

We also disable traps in binaryEdit and baseTramps - since static
binaries cannot load our runtime library.

We still do not handle stripped binary in this commit - but thats
coming soon.

Fortran fixes

Platform-specific guard for platform-specific check

Set the right address width before we emit any code.

Move more variables out of .bss so we can write them with the rewriter.

Add boost include directory to test suite includes.

Enabled many tests in binary rewriter mode.  Still some failures on AMD64.

Fix windows build breakage

Remove bad check from test--modules without code address are legal

Fix issues with line number parsing when we can't find a module

Remove debugging printfs, code cleanup

Fix problem with mis-aligned section entries vs section sizes

Merge branch 'master' of legendre@git.dyninst.org:/pub/dyninst

Fix issues with testsuite not restarting properly after crashes

bug 1022 - fixed (again) loop condition for finding dynamic section in ELF binary

bug 1022 - fixed loop condition for finding dynamic section in ELF binary

Merge branch 'master' of git.dyninst.org:/pub/dyninst

Code generation fixes.

Use correct code generation path in code replacement.

Merge branch 'master' of legendre@git.dyninst.org:/pub/dyninst

Merge branch 'master' of legendre@git.dyninst.org:/pub/dyninst

Conflicts:
dyninstAPI/src/BPatch_binaryEdit.C
dyninstAPI/src/binaryEdit.C

remove debug output leakage

testsuite:  expand DYNINST_REWRITER_NO_UNLINK such that unique filenames are produced for each rungroup, this ensures that binaries are not overwritten by each successive group.  For a given rungroup, only a subset of the rewriter tests will be valid.  This also creates a report file, one per rewritten binary, that contains the list of
tests that were implemented in that particular binary.

Also, if, in a rungroup, one test fails or crashes, all tests in the group were marked with failure.  This changes that:  now if a rewritten mutatee crashes or reports failure, the rungroup is broken apart into individual tests, with each being run seperately to provide a finer grain of reporting on what succeeded and what failed.

test_pt_ls:  update to execute rewritten binary (both automatically via parseThat and manually as a sanity check)

Fixes for intercepting SIGTRAP registration

Add "dyn_signal" to intercept calls to signal()

Add stdlib to include line so that Ginger won't complain it doesn't know what a malloc is.

Merge branch 'master' of git.dyninst.org:/pub/dyninst

Add inter-module call replacement to test1_14F (fortran mode)

Remove debugging statements.
Fix a logic error in emitting static inter-module calls
Recognize shared libraries correctly in the binary rewriter.

Remove debugging statements

testsuite Windows build fixes

Fix issue with emitting 1 byte and 2 byte loads/stores on x86_64